在人类皮肤、粘膜以及与外界相通的腔道中寄居着不同种类和数量的微生物，在人体免疫功能正常时，这些微生物对人无害，称为正常菌群。正常菌群与人体之间的平衡关系在一定条件下可被打破，原来正常情况下不致病的正常菌群就成了条件致病菌。此种特定的情况大致有下列几种：
(1)寄居部位的改变，常导致移位(异位)感染。例如寄居肠道的大肠杆菌进入泌尿道，或手术时通过伤口进入血流、腹腔。
(2)宿主的局部或全身免疫功能下降。
(3)菌群失调：机体某个部位正常菌群中各种细菌的比例发生较大幅度变化，超出正常范围的现象叫菌群失调。例如长期使用广谱抗生素后，抑制了肠道某些正常菌群的生长，而使白念珠菌、金黄色葡萄球菌数量增多，即可导致假膜性肠炎等疾病
