医院领导体制改革的基本原则大致有以下几方面：
（1）必须有利于加强和改善党的领导：在进行医院领导体制改革中，要以"三个代表"的重要思想为指导，坚持党管干部的原则，强化党的领导地位和作用，加强对医院行政、业务工作的监督和保证作用，坚持建设有中国特色的社会主义方向，坚持与时俱进，坚持执政为民，促进精神文明与物质文明共同发展。
（2）必须有利于实行民主管理：医院的民主管理，就是吸收广大职工参与医院管理并监督医院行政业务工作的正确实施。这是党的群众路线在医院管理中的具体运用，也是办好医院的重要保证。在医院贯彻民主管理的组织形式和制度主要是职工代表大会和健全的智囊团体。
（3）必须明确划分各级组织的权限：划分各级组织的权限就是实行分级负责制，就是按照不同的管理层次，对所承担的任务和开展的工作担负责任和后果的管理制度。实行这种严格的分级负责制，可避免职责不清、相互推委、工作拖拉等问题，提高工作效率。
（4）必须简政放权：确定大政方针、进行战略决策、拟订长期发展规划等一些重大的权利应集中于医院领导。各级干部对本职范围内的工作应有权做出规划，并有在本职范围内使用人、财、物的权力。在放权的同时，医院行政机构应本着转变职能、理顺关系、精兵简政、提高效率的原则，进行机构改革，对重复和相近的职能部门进行撤销、合并或调整。
